Poziom pyłków i prognoza dla Kioto

Wiosenny sezon alergiczny w Kioto (luty–maj) jest zdominowany przez pyłki cedru i cyprysu; cedr japoński (Cryptomeria japonica) występuje masowo w górach Kitayama i w Arashiyamie; cyprysik tępołuskowy (Chamaecyparis obtusa) jest szeroko rozpowszechniony wzdłuż wzgórz Higashiyama. Dąb (Quercus serrata) ma znaczący udział, pyląc z północnych obszarów leśnych. Lato (maj–sierpień) charakteryzuje się wysokim stężeniem pyłków traw (Poaceae), pochodzących z brzegów rzek Kamo i Katsura.

Położenie miasta w kotlinie sprawia, że powietrze zostaje uwięzione pomiędzy otaczającymi je pasmami górskimi. Jesienią i zimą odnotowuje się podwyższone stężenie zarodników pleśni (Alternaria, Cladosporium); są one powszechne w wilgotnych ogrodach świątynnych i konstrukcjach drewnianych. Rozkładająca się ściółka liściasta w Ogrodzie Narodowym Gyoen podnosi sezonowy poziom zarodników.