Poziom pyłków i prognoza dla Skopje

Wiosenny sezon alergiczny w Skopje (marzec–maj) jest zdominowany przez pyłki brzozy i topoli; brzoza (Betula) występuje obficie w Parku Miejskim oraz wzdłuż rzeki Wardar. Pyłki topoli (Populus), dębu (Quercus) i sosny (Pinus) pochodzą ze zboczy góry Vodno. Latem (maj–lipiec) odnotowuje się wysokie stężenia traw (Poaceae); ich źródłem są między innymi pola w pobliżu dzielnicy Saraj oraz obrzeża miasta. Późnym latem (sierpień–październik) występują szczytowe stężenia ambrozji (Ambrosia); roślina ta jest powszechnie spotykana na nieużytkach miejskich w całej Kotlinie Skopje.

Położenie miasta w kotlinie oraz częste inwersje temperatury sprzyjają zatrzymywaniu cząsteczek w powietrzu, a otaczające góry ograniczają ich rozprzestrzenianie przez wiatr. Jesienią i zimą utrzymują się wysokie stężenia zarodników pleśni (Alternaria, Cladosporium); ich źródłem są między innymi wilgotne pryzmy liści w Parku Miejskim oraz roślinność nadrzeczna.